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Con la risposta n. 171 dell’11 settembre 2026, l’Agenzia delle Entrate chiarisce il trattamento fiscale di una fusione per incorporazione di una Società semplice in una Fondazione iscritta al RUNTS e qualificata come Ente del Terzo settore (ETS).
Il caso esaminato riguarda una Fondazione che deteneva la partecipazione di maggioranza in una Società Agricola Semplice, proprietaria di un patrimonio immobiliare comprendente terreni agricoli. La Società Semplice aveva concesso in affitto l’azienda agricola e, al momento della fusione, non svolgeva più direttamente attività agricola.
L’Agenzia ricorda che la neutralità fiscale prevista dall’articolo 172 del TUIR per le fusioni opera, per quanto applicabile, anche alle fusioni di enti diversi dalle società. Tuttavia, occorre verificare la destinazione dei beni nell’ambito dell’ente incorporante.
Nel caso concreto, gli immobili continueranno a far parte dell’azienda agricola e resteranno utilizzati, anche indirettamente tramite l’affittuario, per l’esercizio dell’attività agricola. Pertanto, le eventuali plusvalenze relative ai beni trasferiti con la fusione non assumono rilevanza reddituale ai sensi dell’articolo 67 del TUIR. Gli stessi beni conservano inoltre il costo fiscalmente riconosciuto posseduto presso la Società Semplice.
IVA e imposte dirette
Sul fronte IVA, l’Agenzia considera la fusione fuori dal campo di applicazione dell’imposta, poiché, al momento dell’operazione, la Società Semplice aveva concesso integralmente in affitto l’azienda agricola e non svolgeva più direttamente attività agricola. Manca quindi il presupposto soggettivo IVA.
Per le imposte indirette trova invece applicazione l’articolo 82, comma 3, del Codice del Terzo settore. La disposizione prevede che, per le operazioni di fusione, scissione o trasformazione poste in essere dagli ETS, le imposte di registro, ipotecaria e catastale si applichino in misura fissa.
L’Agenzia conferma quindi l’applicazione della tassazione in misura fissa perché, dopo la fusione, la Fondazione conserva la qualifica di Ente del Terzo settore iscritto al RUNTS.

